MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 43083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020834	AGA	2	6	27311	27316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335263
502	NC_020834	TG	3	6	27354	27359	0 %	50 %	50 %	0 %	472335263
503	NC_020834	GCA	2	6	27393	27398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335263
504	NC_020834	ATC	2	6	27415	27420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335263
505	NC_020834	TATATG	2	12	27421	27432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472335263
506	NC_020834	A	6	6	27487	27492	100 %	0 %	0 %	0 %	472335263
507	NC_020834	GCG	2	6	27612	27617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335263
508	NC_020834	GCA	2	6	27627	27632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335263
509	NC_020834	GCT	2	6	27639	27644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335263
510	NC_020834	CAA	2	6	27681	27686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335263
511	NC_020834	TATT	2	8	27723	27730	25 %	75 %	0 %	0 %	472335263
512	NC_020834	CAGCCA	2	12	27741	27752	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	472335263
513	NC_020834	ATC	2	6	27851	27856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335264
514	NC_020834	TGT	2	6	27870	27875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335264
515	NC_020834	AAT	2	6	27930	27935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335264
516	NC_020834	A	6	6	27945	27950	100 %	0 %	0 %	0 %	472335264
517	NC_020834	TGTT	2	8	27998	28005	0 %	75 %	25 %	0 %	472335264
518	NC_020834	GTT	2	6	28223	28228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335265
519	NC_020834	T	6	6	28227	28232	0 %	100 %	0 %	0 %	472335265
520	NC_020834	ATC	2	6	28246	28251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335265
521	NC_020834	ATA	2	6	28279	28284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335265
522	NC_020834	AAT	2	6	28328	28333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335265
523	NC_020834	ATA	2	6	28346	28351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335265
524	NC_020834	TAA	2	6	28368	28373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335265
525	NC_020834	T	7	7	28420	28426	0 %	100 %	0 %	0 %	472335265
526	NC_020834	CAC	2	6	28454	28459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335265
527	NC_020834	AAT	2	6	28477	28482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335265
528	NC_020834	TCT	2	6	28609	28614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335266
529	NC_020834	TAA	3	9	28630	28638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335266
530	NC_020834	GTTT	2	8	28697	28704	0 %	75 %	25 %	0 %	472335266
531	NC_020834	ATC	2	6	28732	28737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335266
532	NC_020834	CAT	2	6	28764	28769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335266
533	NC_020834	TCC	2	6	28808	28813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335266
534	NC_020834	AGA	2	6	28816	28821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335266
535	NC_020834	AAT	2	6	28838	28843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335266
536	NC_020834	ATT	2	6	29229	29234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335267
537	NC_020834	AGC	2	6	29297	29302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335267
538	NC_020834	TTC	2	6	29307	29312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335267
539	NC_020834	CCG	2	6	29386	29391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335267
540	NC_020834	GCA	2	6	29399	29404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335267
541	NC_020834	TCA	2	6	29447	29452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335267
542	NC_020834	ACA	2	6	29459	29464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335267
543	NC_020834	TGG	2	6	29503	29508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335267
544	NC_020834	GCC	2	6	29590	29595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335267
545	NC_020834	GCTT	2	8	29685	29692	0 %	50 %	25 %	25 %	472335267
546	NC_020834	CAC	2	6	29781	29786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335267
547	NC_020834	GGC	2	6	29910	29915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335267
548	NC_020834	TGG	2	6	29958	29963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335267
549	NC_020834	CAA	2	6	29991	29996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335267
550	NC_020834	TGC	2	6	30157	30162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335267
551	NC_020834	GTT	2	6	30224	30229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335267
552	NC_020834	T	6	6	30392	30397	0 %	100 %	0 %	0 %	472335267
553	NC_020834	ACT	2	6	30412	30417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335267
554	NC_020834	CCTG	2	8	30463	30470	0 %	25 %	25 %	50 %	472335267
555	NC_020834	CAAT	2	8	30559	30566	50 %	25 %	0 %	25 %	472335267
556	NC_020834	GT	3	6	30572	30577	0 %	50 %	50 %	0 %	472335267
557	NC_020834	ATT	2	6	30595	30600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335267
558	NC_020834	TAA	2	6	30706	30711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335268
559	NC_020834	TCA	2	6	30723	30728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335268
560	NC_020834	AAT	2	6	30803	30808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335268
561	NC_020834	T	6	6	30900	30905	0 %	100 %	0 %	0 %	472335268
562	NC_020834	TTA	2	6	30909	30914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335268
563	NC_020834	GTG	2	6	30938	30943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335268
564	NC_020834	GTT	2	6	30991	30996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335268
565	NC_020834	AAC	2	6	31090	31095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335268
566	NC_020834	ATG	2	6	31167	31172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335268
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568	NC_020834	CAT	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335268
569	NC_020834	GACC	2	8	31228	31235	25 %	0 %	25 %	50 %	472335268
570	NC_020834	A	6	6	31236	31241	100 %	0 %	0 %	0 %	472335268
571	NC_020834	TTG	2	6	31427	31432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335268
572	NC_020834	GTT	2	6	31723	31728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335269
573	NC_020834	CAC	2	6	31731	31736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335269
574	NC_020834	TAAGT	2	10	31846	31855	40 %	40 %	20 %	0 %	472335269
575	NC_020834	TCG	2	6	32024	32029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335269
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577	NC_020834	AAT	2	6	32194	32199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335269
578	NC_020834	CCA	2	6	32399	32404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335269
579	NC_020834	GCG	2	6	32447	32452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335269
580	NC_020834	GTTG	2	8	32454	32461	0 %	50 %	50 %	0 %	472335269
581	NC_020834	CTT	2	6	32517	32522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335269
582	NC_020834	ACC	2	6	32548	32553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335269
583	NC_020834	GTCC	2	8	32619	32626	0 %	25 %	25 %	50 %	472335269
584	NC_020834	GCT	2	6	32648	32653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335269
585	NC_020834	CTT	2	6	32670	32675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335269
586	NC_020834	GTC	2	6	32686	32691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335269
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589	NC_020834	T	6	6	32797	32802	0 %	100 %	0 %	0 %	472335270
590	NC_020834	TTG	2	6	32917	32922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335270
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593	NC_020834	AGTA	2	8	33035	33042	50 %	25 %	25 %	0 %	472335270
594	NC_020834	TTG	2	6	33073	33078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335270
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596	NC_020834	CCA	2	6	33188	33193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335270
597	NC_020834	CATA	2	8	33198	33205	50 %	25 %	0 %	25 %	472335270
598	NC_020834	ACCA	2	8	33233	33240	50 %	0 %	0 %	50 %	472335270
599	NC_020834	CACAA	2	10	33545	33554	60 %	0 %	0 %	40 %	472335270
600	NC_020834	GGT	2	6	33682	33687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335270
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602	NC_020834	AC	3	6	33711	33716	50 %	0 %	0 %	50 %	472335270
603	NC_020834	GATA	2	8	33781	33788	50 %	25 %	25 %	0 %	472335270
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605	NC_020834	TTGAT	2	10	33807	33816	20 %	60 %	20 %	0 %	472335270
606	NC_020834	GTTT	2	8	33817	33824	0 %	75 %	25 %	0 %	472335270
607	NC_020834	T	6	6	34032	34037	0 %	100 %	0 %	0 %	472335271
608	NC_020834	GACT	2	8	34039	34046	25 %	25 %	25 %	25 %	472335271
609	NC_020834	AGT	2	6	34093	34098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335271
610	NC_020834	AAT	2	6	34179	34184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335271
611	NC_020834	TTG	2	6	34207	34212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335271
612	NC_020834	TCT	2	6	34264	34269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335271
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616	NC_020834	ATA	2	6	34631	34636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335271
617	NC_020834	CCTGC	2	10	34652	34661	0 %	20 %	20 %	60 %	472335271
618	NC_020834	ATC	2	6	34684	34689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335271
619	NC_020834	C	6	6	34781	34786	0 %	0 %	0 %	100 %	472335271
620	NC_020834	CT	3	6	34801	34806	0 %	50 %	0 %	50 %	472335271
621	NC_020834	AG	3	6	35124	35129	50 %	0 %	50 %	0 %	472335271
622	NC_020834	TCAA	2	8	35185	35192	50 %	25 %	0 %	25 %	472335271
623	NC_020834	TGG	2	6	35269	35274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335271
624	NC_020834	TTG	2	6	35293	35298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335271
625	NC_020834	T	6	6	35327	35332	0 %	100 %	0 %	0 %	472335271
626	NC_020834	CAT	2	6	35462	35467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335271
627	NC_020834	CCG	2	6	35471	35476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335271
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